Modyfikacje genetyczne w rolnictwie mają głównie na celu:
- uodpornienie na działanie szkodników, chorób, zmian temperatur itp. - przystosowanie gatunków roślin do życia w zmienionym klimacie - przedłużenie trwałości roślin - unormowanie stężenia fitoestrogenów, - zwiększenie zawartości suchej masy, - polepszenie składu kwasów tłuszczowych oraz aminokwasów białek, - zmianę zawartości węglowodanów, karotenoidów i witamin, - usunięcie składników szkodliwych, toksyn, związków utrudniających przyswajanie składników, związków które podczas obróbki kulinarnej ulegają reakcjom chemicznym wytwarzając toksyny, zwiększając np. zawartość nutraceutyków, czyli substancji niezbędnych dla zdrowia,
Znanymi roślinami modyfikowanymi genetycznie w rolnictwie są: bawełna, buraki cukrowe, kukurydza, pomidory, rzepak, ziemniaki.